5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit (vanligtvis förkortat DMT-dC(Bz,5AS-fosforamidit) Phosphoramidit 105931-57-5) är en modifierad deoxiribonukleosid-fosforamiditmonomer med en 5-metylcytosinbas med en N4-bensoylskyddande grupp, ett 2'-deoxiribossocker, en 5'-etyl-O-dimetoxytritylgrupp (D-metoxytrityl) och fosforamidit i 3′‑positionen. 5-metylcytosinmodifieringen förekommer naturligt i DNA som en epigenetisk markör (CpG-metylering) och används också flitigt i antisensoligonukleotidkemi (ASO) för att förbättra nukleasresistens och modulera bindningsaffinitet. När de inkorporeras i oligonukleotider, parar 5-metylcytosin-bas med guanin i standard Watson-Crick-geometrin men känns inte igen som ett substrat för vissa DNA-metyltransferaser, beroende på sekvenskontexten. 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit är en kritisk byggsten för syntesen av CpG-kleotidmönster med antisens som oligonu som definieras av metylklottid. läkemedel där 5-metylgruppen minskar immunstimulering och ökar duplex termisk stabilitet.
5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit är standardmonomeren för att introducera 5-metyl-DNA-rester och syncytidin-rester i antisyncytidin-DNA. oligonukleotider. N4-bensoylgruppen skyddar den exocykliska aminen i cytosinbasen och förhindrar förgreningsreaktioner under fastfassyntes. 5-metylgruppen på cytosinringen ökar den termiska stabiliteten hos duplex bildade med komplementärt DNA eller RNA (ΔTm ≈ +0,5–1,0°C per modifiering) och, viktigare, minskar den immunstimulerande potentialen hos CpG-motiv när de används i antisense eller CpG-baserade vacciner. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit är helt kompatibel med standard DNA-syntescykler (kopplingstid 2–3 minuter, t.ex. deprotetrazol) och standardbetingelser för deprotetrazol, såsom teCI, (koncentrerad NH3, 55°C, 8–16 timmar). 5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit är också en nyckelmellanprodukt i syntesen av låst nukleinsyra (LNA) när det kombineras med modukleinsyra (LNA) monomerer. Denna fosforamidit används ofta vid tillverkning av FDA-godkända antisensläkemedel och i forskningsapplikationer som utforskar epigenetisk reglering och DNA-metyleringsanalys.
● Utseende – färglös till ljusgul till ljusorange klar vätska
Ett omfattande COA, MSDS (med fullständig GHS-information) och ursprungscertifikat följer med varje försändelse.
Förvaringsvillkor
Förvara 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit i en tätt försluten behållare under inert atmosfär (kväve eller argon) för långtidsförvaring vid –20°C. Korttidsförvaring (upp till 3 månader) vid 2–8°C under uttorkning kan vara acceptabelt men rekommenderas inte under längre perioder. Håll behållaren torr, skyddad från ljus och borta från starka oxidationsmedel och syror. Blandningen är mycket fuktkänslig; öppna endast under vattenfria förhållanden (handskfack eller med argonrening). Efter öppning, återställ oanvänt material till –20°C omedelbart under argon.
Hållbarhet: 2–3 år vid förvaring vid –20°C i en förseglad, inert renad behållare med torkmedel.
Hanteringsföreskrifter: Använd i dragskåp. Bär nitrilhandskar, skyddsglasögon och en labbrock. Undvik att generera damm. Tvätta händerna efter hantering. Se SDS för fullständig säkerhetsinformation.
Produktfördelar
1. 5-metylcytosin för förbättrad duplexstabilitet och nukleasresistens
5-metylgruppen på cytosinbasen ökar smälttemperaturen (Tm) för DNA/DNA och DNA/RNA-duplex med cirka 0,5–1,0°C per modifiering. Denna termiska stabilisering är särskilt värdefull i antisensoligonukleotider, där högre bindningsaffinitet översätts till förbättrad styrka och reducerad erforderlig dos. Metylgruppen ger också ökad resistens mot vissa nukleaser.
2. Minskad immunstimulering av CpG-motiv
Ometylerade CpG-dinukleotider känns igen av Toll-like receptor 9 (TLR9) i humana immunceller, vilket leder till oönskade immunstimulerande effekter. Inkorporering av 5-metylcytosin i CpG-motiv (omvandlar CpG till 5-meCpG) tar bort TLR9-igenkänning, vilket minskar cytokinfrisättning utanför målet i antisense- och siRNA-applikationer. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit möjliggör denna kritiska immunmodulering.
3. Fullständig kompatibilitet med standard DNA-syntes och avskyddande
5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit använder samma skyddsgruppschema som standard 2''-deoxicytidin (D-fosphoramidit) N4, CE vid 3′), där den enda skillnaden är 5-metylsubstituenten. Därför krävs inga ändringar av syntescykler, aktivatorlösningar eller avskyddande förhållanden - det fungerar sömlöst på alla vanliga DNA-syntes.
4. Viktigt för CpG Island Methylation Studies
I epigenetisk forskning används oligonukleotider med definierade 5-metylcytosinmönster som substrat för metyltransferaser, som standarder för bisulfitsekvensering och som sonder för metylbindande proteiner. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit gör det möjligt för forskare att syntetisera skräddarsydda metylerade DNA-sekvenser utan enzymatisk metylering eller heterogenitet. mönster.
5. Antisens-oligonukleotidterapi
Flera FDA-godkända antisensläkemedel (t.ex. nusinersen, inotersen) innehåller 5-metylcytosinrester för att förbättra stabiliteten och minska immunogeniciteten. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitrityl)-N4-bensoyl-2'-deoxi-5-Metylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoetyl-N,N-diisopropylaMino) fosforamidit är den monomer som väljs för tillverkning av sådana läkemedel i kommersiell skala.
Kontakta oss
Letar du efter en pålitlig leverantör av 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-deoxy-5-Methylcytidine-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidite? Cosperpharm är redo att tillhandahålla högkvalitativa produkter, omfattande dokumentation och lyhörd teknisk support.
Vi använder cookies för att ge dig en bättre webbupplevelse, analysera webbplatstrafik och anpassa innehåll. Genom att använda denna sida godkänner du vår användning av cookies. Sekretesspolicy