Bz-rC Fosforamidit

Bz-rC Fosforamidit är en fundamental monomer för den kemiska syntesen av RNA-oligonukleotider. N4‑bensoylskyddsgruppen på cytosinbasen förhindrar förgrening och kedjeterminering under fosforamiditkopplingscykeln, medan 2′-O‑TBDMS-gruppen skyddar 2′-hydroxylen genom hela kedjesammansättningen och avlägsnas efter syntes med fluoridbaserade reagenser såsom trietylamintrihydrofluorid (TEHF3). Bz-rC Phosphoramidite är kompatibel med standardprotokoll för RNA-syntes på automatiserade DNA/RNA-syntes (t.ex. Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo), vanligtvis med användning av 0,25 M aktivatorlösningar (5-etyltio-1H-tetrazol, 4,5-kopplande dikylamidazol och 4,5 gånger dikanoimidazol). 5–10 minuter. Bz-rC Phosphoramidite har validerats omfattande i syntesen av RNA för strukturella studier, antisensoligonukleotider, siRNA och aptamerer. Bz-rC Fosforamidit används också som referensstandard vid oligonukleotidföroreningsprofilering, eftersom bensoylgruppen kan ge upphov till karakteristiska biprodukter (t.ex. N4-bensoyl-depyrimidineringsprodukter) som måste övervakas under processutvecklingen.

Produktparametrar

Kvalitetssäkring på Cosperpharm

Varje batch genomgår:

● Gaskromatografi (GC) – renhet ≥97,0 %

● Icke-vattenhaltig titrering – renhet ≥97,0 %

● Brytningsindex – bekräftande analys

● ¹H NMR – strukturell verifiering

● Utseende – färglös till ljusgul till ljusorange klar vätska

Ett omfattande COA, MSDS (med fullständig GHS-information) och ursprungscertifikat följer med varje försändelse.

FAQ

F1: Vad är skillnaden mellan Bz-rC Phosphoramidite och Ac-rC Phosphoramidite?

S: Bz-rC Fosforamidit använder en bensoyl (Bz) skyddande grupp på den exocykliska N4 aminen av cytosin, medan Ac-rC använder en acetyl (Ac) grupp. Bensoylgruppen ger ett bättre skydd mot depyrimidinering under sura betingelser för DMT-avlägsnande (3 % triklorättiksyra i diklormetan). För de flesta tillämpningar för RNA-syntes är bensoylgruppen att föredra för långa eller deoxycytidinrika sekvenser.

F2: Vilken är den rekommenderade kopplingstiden för Bz-rC Phosphoramidite på en standardsynt?

S: Under standardbetingelser för RNA-syntes med 0,25 M aktivator (t.ex. 5-etyltio-1H-tetrazol eller 4,5-dicyanoimidazol), är en kopplingstid på 5–10 minuter typisk för Bz-rC-fosforamidit. För längre oligonukleotider (>40-mer) eller syntes med hög genomströmning kan optimering av aktivatorkoncentration och kopplingstid förbättra utbyten.

Produktapplikationsscenarier

1.RNA-oligonukleotidsyntes

Bz-rC Phosphoramidite är standardbyggstenen för att introducera cytidinrester i syntetiska RNA-oligonukleotider för forskning, diagnostik och terapeutisk utveckling.

2.siRNA tillverkning

Används för att införliva 2'-OH-cytidin i siRNA-duplex. TBDMS-gruppen tas bort efter syntes, vilket ger helt naturligt RNA för RNAi-studier.

3. Antisensoligonukleotidsyntes (ASO).

ASO:er som riktar in sig på RNA-transkript kräver RNA-segment (t.ex. i gapmer-designer). Bz-rC Phosphoramidite förser de nödvändiga cytidinresterna med full nukleasresistens när den lämnas som 2'-OH eller modifierad.

4.RNA Aptamer Generation

Aptamer-bibliotek och individuella aptamer-kandidater syntetiseras kemiskt med Bz-rC Phosphoramidite för att säkerställa sekvenstrohet och skalbarhet.

5. Strukturell biologi RNA-beredning

För röntgenkristallografi och NMR-studier måste väldefinierade RNA-sekvenser syntetiseras med hög renhet. Bz-rC Phosphoramidite ger den erforderliga kopplingseffektiviteten och renhet för avlägsnande av skydd.

6. Referensstandard för föroreningsprofilering

Som en potentiell processförorening i oligonukleotidläkemedelssubstanser (t.ex. kvarvarande N4-bensoyl-cytidin, ofullständiga avskyddande produkter), fungerar Bz-rC Phosphoramidite eller dess avskyddade derivat som referensstandarder i HPLC- och LC-MS-metoder.

Kontakta oss

Redo att beställa Bz-rC Phosphoramidite för ditt nästa RNA-syntesprojekt? Cosperpharms team står redo för att diskutera dina renhetskrav, dokumentationsbehov och leveranstidslinjer.